Przy Muzeum działa Rada Muzeum, której członków powołuje i odwołuje Zarząd Województwa Mazowieckiego .
Tryb powołania Rady Muzeum, czas trwania jej kadencji, a także zakres jej działalności określa ustawa z dnia 21 listopada 1996r. o muzeach.
Szczegółowy tryb pracy Rady Muzeum określa uchwalony przez nią regulamin.
Rada Muzeum liczy dziesięciu członków:
Skład osobowy Rady Muzeum – kadencja 2020-2024:
- Adam Struzik
- Tomasz Kominek
- Beata Szczepańska
- Leonard Sobieraj
- Roman Kochanowicz
- Grzegorz Gańko
- Alicja Mironiuk – Nikolska
- Łukasz Maurycy Stanaszek
- Jarosław Perzyński
- Ewa Jaszczak